Yeni araştırmalar, COVID-19 Omicron varyantında bulunan 46 mutasyonun, yüksek sayıda yeniden enfeksiyon ve çığır açan vakaları hesaba katarak antikorları etkisiz hale getirdiğini gösteriyor.
Minnesota Üniversitesi tarafından yürütülen yeni bir araştırma, son derece bulaşıcı COVID-19 Omicron varyantının, insan vücudunda önceden var olan antikorlardan kaçmasına izin veren ve yüksek enfeksiyon oranını hesaba katan çok sayıda benzersiz spesifik mutasyona sahip olduğunu buldu.
“Omicron SARS-CoV-2 varyantı: Benzersiz özellikler ve önceden var olan antikorlar üzerindeki etkisi” başlıklı hakemli çalışma ilk olarak Otoimmünite Dergisi’nde yayınlandı ve Missouri Üniversitesi’nde profesör olan Kamlendra Singh tarafından üretildi. Veteriner Hekimliği ve kolejin Moleküler Etkileşimler Çekirdeği ve Bond Yaşam Bilimleri Merkezi araştırmacısının müdür yardımcısı.
Araştırma ekibi, Omicron varyantının spike proteininde (S-protein) bulunan mutasyonlar hakkında veri toplamak için yola çıktı. Bir S-proteini, virüsün en dış tabakasının yüzeyinden çıkıntı yapan büyük bir yapıyı ifade eder ve bunlar en yaygın olarak tüm koronavirüs hücre formlarıyla ilişkilidir.
Araştırma ekibi, Omicron S-proteininde eşi görülmemiş sayıda mutasyon buldu. Yüksek sayıda mutasyonun antikorların virüse bağlanması üzerindeki olası etkisini anlamak için virüsün mevcut dizilerini ve spike protein üzerindeki yapısal verileri analiz ettiler.
Araştırma ekibi, Omicron varyantının tam dizilerini kullanarak, varyant içinde 23’ü tamamen benzersiz olan ve virüsün daha önceki varyantlarının hiçbirinde tanımlanmayan 46 imza mutasyonu belirledi. Mutasyonlardan ikisi ilk olarak Omicron’dan birkaç ay önce Delta veya Delta Plus varyantında kaydedilmişti.
Bulunan 46 mutasyondan 30’u S-proteininde tanımlanırken, geri kalanı virüs hücresinde başka bir yerde bulunuyordu.
Omicron varyantında bulunan benzersiz mutasyonları belirledikten sonra ekip, varyanta karşı antikor yanıtı eksikliğinden sorumlu olup olmadıklarını araştırmaya yöneldi.
Antikorların bir virüse bağlanmasını teorik olarak önleyecek olan Protein Veri Bankasından alınan önceden var olan bir S-protein yapısını kullanarak, Omicron mutasyonlarının benzer şekilde COVID-19 S-proteinini etkileyip etkilemeyeceğini ve böylece antikorları etkisiz hale getirip getirmeyeceğini değerlendirmek için çalıştılar. .
Bu yöntem sayesinde ekip, belirli mutasyonların virüsün yüzeyinde parazit oluşturarak antikorların ona bağlanmasını engellediğini, diğerlerinin ise antikorlar ve virüs arasındaki etkileşimin tamamen kaybolmasına neden olduğunu ve böylece antikorları yüksek düzeyde virüse karşı etkisiz hale getirdiğini keşfetti. mutasyona uğramış varyant.
Bu, önceden var olan bağışıklamanın (aşılamadan veya önceki enfeksiyondan) artık Omicron varyantına karşı optimum koruma sağlayamayabileceğini ve antikorları atlamasına ve bağışıklık sistemine girmesine izin verdiğini söyledi.
Singh, “Antikorların amacı, virüsü tanımak ve enfeksiyonu önleyen bağlanmayı durdurmaktır.” Dedi. “Ancak, Omicron varyantındaki mutasyonların çoğunun, antikorların bağlanması gereken yerde bulunduğunu bulduk, bu yüzden virüsün potansiyel olarak mevcut antikorlardan kaçabilecek veya onlardan kaçabilecek ve dolayısıyla devam edebilecek şekilde nasıl gelişmeye devam ettiğini gösteriyoruz. Bu gelişim çok insana bulaştırmak için.”